Вопросы калькулирования себестоимости всегда были актуальными, но в условиях острой конкуренции и модернизации экономики России они приобретают особую значимость. Рынок предполагает стремлении организаций к получению прибыли не за счет увеличения цены на предлагаемую продукцию, работу, услугу, а за счет снижения себестоимости, что предопределяет необходимость максимально точного калькулирования себестоимости и организацию оперативного контроля за затратами. Сегодня одним из активно используемых методов, используемых для этих целей, является метод учета затрат по видам деятельности (АВС-метод). В статье представлены организационно-методические рекомендации по использованию АВС-метода в организациях, оказывающих транспортные услуги. Изучение и анализ мнений различных авторов по вопросам использования данного метода позволил выявить его основные характеристики, преимущества и недостатки, которые были учтены при формировании рекомендаций. Изучение практической деятельности транспортных организаций создало основу для выделения отраслевых особенностей и специфических характеристик видов, оказываемых автотранспортных услуг, они были приняты во внимание при выборе драйвера операций. Представленный в статье вариант распределения косвенных затрат на примере данных конкретной организации позволил сделать вывод о целесообразности применения АВС метода только для определения финансового результата по видам оказываемых услуг и использования данной информации при расчете нижнего уровня цены на услуги, а также обосновать необходимости интеграции АВС метода с другими методами калькулирования себестоимости для организаций, оказывающих транспортные услуги.